Net als de Nintendo Wii kent de 3DS een “Home”-knop, die je laat terugkeren naar het hoofdmenu, zelfs al ben je in het midden van een game. Echter, er is een zeer groot verschil tussen de twee, want de 3DS kan multi-tasken.
Het is zonder je spel af te sluiten mogelijk om bijvoorbeeld een internetpagina op de Nintendo 3DS open te maken of bijvoorbeeld een applicatie genaamd Game Notes op te starten. Hierin is het mogelijk om aantekeningen te maken op het touchscreen van het apparaat, terwijl je game op het bovenste scherm stil blijft staan. Ook is het mogelijk om op beide schermen de screenshot af te laten beelden om op dit plaatje te kunnen tekenen. De aantekeningen die gemaakt zijn kunnen vervolgens opgeslagen worden op een SD-kaartje.