Lineage is de prequel op het verhaal van Assassin’s Creed II, je ziet de gebeurtenissen die vooraf gaan aan het begin van Assassin’s Creed II.
Na de brute moord op de hertog van Milaan, gaat Giovanni Auditore op onderzoek uit. Zijn missie is te achterhalen waarom en wie achter de moord zit. Het spoor leidt hem naar de machtigste families, zelfs naar het Vaticaan. Wanneer Giovanni te dicht bij de waarheid komt, wordt hij ook een doelwit. Nu moet hij de samenzweerders ontmaskeren voordat hij de volgende naam op de groeiende lijst van slachtoffers wordt.
Na de losse episodes kun je nu de volledige versie van Lineage bekijken.