In een interview met de makers van Splinter Cell: Double Agent komt nog eens fijntjes naar voren waarom wij binnenkort massaal voor de lokale gameboer kamperen om deze game te bemachtigen. Men verklaart, in het filmpje wat je hieronder kunt vinden, de subtitel ‘Double Agent’. Oké, dat wisten we al. Maar het is en blijft Sam en daar kunnen wij geen genoeg van krijgen.
Sam Fisher verliest in het nieuwe deel zijn dochter, ten gevolge van een tragisch auto-ongeval. Sam loopt hierdoor een trauma op en blijft maar aan zijn dochter denken. Om even aan iets anders te denken, vraagt hij aan Lambert of hij geen opdracht heeft. Sam wordt een baan aangeboden als NOC agent, waardoor hij zich tussen de bendes zal infiltreren om informatie te verschaffen. Zijn eerst bende is de John’s Brown Army, JBA. Door een brute bankoverval komt Sam echter in de gevangenis. De NSA, de organisatie welke achter Sam staat, zal Sam af en toe opdrachten geven. Sam Fisher blijft echter ook nog lid van de JBA en zal zijn loyaliteit moeten bewijzen en opdrachten uit moeten voeren. Als we dan vervolgens horen dat delen van het verhaal zich in Shanghai en een oorlogsgebied in Afrika afspelen, worden we helemaal benieuwd.